Aplikácia Nastavenia pera je spôsob, ako prispôsobiť zariadenie s funkciou Wacom. Pri inštalácii na PC s senzorom Wacom Pen vloženým do obrazovky môžete prispôsobiť tlačidlá Pens, citlivosť na tlak a naklonenie a využiť ponuku Radial Menu pre rýchly prístup k pokročilým funkciám.