Tres hombres, amigos desde la infancia, desempeñan importantes funciones en sus comunidades: profesor, alcalde, banquero... Pero cuando un meteorito cae no muy lejos de la ciudad, el profesor Gustav se entera de que el meteorito emana algún tipo de energía desconocida, y comienza una serie de experimentos sin el permiso del alcalde. Financiado por el banquero, el profesor construye una máquina maligna que hace que la energía del meteorito gire sin control, destruyendo la ciudad y mutando sus plantas y animales. Los ciudadanos son evacuados, pero los rescatistas no logran encontrar y evacuar a dos niños. En Questerium: Sinister Trinity HD, interpretas al investigador contratado para trabajar en el caso, y de ti depende destruir la máquina maligna, rescatar a los niños abandonados, salvar la ciudad y arrestar al profesor.