鸿鹄3D化学是一个用于3D化学结构的分子查看/化学结构式绘制器，采用了非常简洁直观的操作界面，可以通过3D建模的方式来为用户展示出每个分子所独有的结构体，能提供与其它应用程序的接口，它可以读取 60 多种文件类型，包括PDB，CIF，SDF，MOL，PyMOL PSE文件和Spartan文件，以及Gaussian，GAMESS，MOPAC，VASP，CRYSTAL，CASTEP，QuantumEspresso，VMD和许多其他量子化学程序的输出。文件可以直接从多个数据库传输，包括RCSB，EDS，NCI，PubChem和MaterialsProject。可以加载和比较多个文件。功能包括交互式动画和线性变形。它与JSpecView的光谱学，Ketcher的2D->3D转换，图像的POV-Ray以及3D打印（VRML导出）的CAD程序很好地连接。同时它还支持一键插入Office,大大的提高了工作效率。
