I Crysis 3 Remastered ligger världens öde återigen i dina händer. Du återvänder till kampen som supersoldaten Prophet, med den kraftfulla, automatiskt laddande Predator Bow, som kan skjuta elektriska, explosiva och kolpilar. Ta dig an nya och gamla fiender som hotar freden som du arbetat så hårt för att uppnå. Sökandet efter utomjordingen Alpha Ceph fortsätter. Nu måste du även exponera sanningen bakom företaget C.E.L.L., som har gjort New York till en växande urban regnskog skyddad av en stor nanokupol. Du är utrustad med din nanodräkt och måste bedöma, anpassa och attackera för att välja din väg och ta dig genom de sju distrikten. Utplåna dina motståndare med den råa kraften i din nanodräkts överlägsna teknik eller använd smygteknik för att uppnå dina mål och bli mänsklighetens tysta räddare. Det finns inget fel sätt att rädda världen.