Lincoln Six-Echo (Ewan McGregor) lebt Mitte des 21. Jahrhunderts in einer scheinbar utopischen Wohneinheit, die in Wirklichkeit ein Gefängnis ist. Wie alle Bewohner dieser vollständig überwach ten Welt hofft Lincoln, irgendwann auf "Die Insel" reisen zu dür fen - angeblich die letzte Oase auf der Erde, wo die Umwelt noch intakt ist. Doch bald entdeckt Lincoln, dass sein gesamtes Lebe n eine einzige Lüge ist. In Wahrheit sind er und alle anderen Be wohner der Anlage menschliche Klone, die nur dazu dienen, "Ersat zteile" für ihre menschlichen Originale zu liefern. Lincoln muss also damit rechnen, dass demnächst auch seine "Erntezeit" anbri cht. Deshalb wagt er mit seiner schönene Mitbewohnerin Jordan Tw o-Delta (Scarlett Johansson) die Flucht. Sofort nehmen die Scher gen des unheimlichen Instituts, dem sie gerade entkommen sind, d ie Verfolgung auf. Lincoln und Jordan setzen ihr Leben aufs Spie l, um ihren Schöpfern von Angesicht zu Angesicht gegenüberzutret en.