Im Jahre 2067 entscheidet sich Japan aus den Vereinten Nationen auszutreten. 2077 erhält die NATO einen Bericht über eine neue Superwaffe der Japaner und deren Plan, damit die Welt zu erobern. Man entsendet die Spezialeinheit SWORD, doch deren Infiltrierung endet in einer Katastrophe. Nur die Kommandantin Vexille, überlebt und erfährt sie aber was sich im abgeschotteten Tokyo passiert.